Izolacja DNA z badanego szczepu jest opcjonalna – możliwe jest przesłanie do laboratorium już oczyszczonego materiału genetycznego wyizolowanego z czystej kultury (materiał po otrzymaniu zostanie poddany analizie ilościowej i jakościowej).
Izolacja DNA w CBR Sanprobi przeprowadzana jest w oparciu o zestawy odczynników dedykowanych komórkom bakteryjnym (G+ oraz G-), wykorzystując metody manualne oraz zautomatyzowane.