poznaj

Centrum Badawczo-Rozwojowe

Centrum Badawczo-Rozwojowe (CBR) SANPROBI to nowoczesne laboratorium, w którym pracuje zespół doświadczonych naukowców specjalizujących się w mikrobiologii ogólnej, środowiskowej, przemysłowej oraz biotechnologii. Korzystamy z nowoczesnej aparatury, aby prowadzić badania nad jakością produktów probiotycznych oraz przeprowadzać analizy dotyczące struktury i funkcji bariery jelitowej oraz terapii jej zaburzeń.

W naszym centrum realizowane są liczne projekty naukowe, które łączą metody mikrobiologii klasycznej, biologii molekularnej, cytometrii przepływowej i spektrometrii mas. Nasz zespół, bazujący na doświadczeniu i wiedzy wybitnych naukowców oraz lekarzy, jest gotowy na nowe wyzwania i chętnie pomoże Państwu odkrywać świat mikroorganizmów w ramach prac badawczo-rozwojowych.

APARATURA

nasi specjaliści

Pracownicy CBR SANPROBI

Prof. dr hab. n. med. i n. o zdr. Karolina Skonieczna-Żydecka

Dyrektor Centrum Badawczo-Rozwojowego SANPROBI

Prof. Karolina Skonieczna-Żydecka jest uznaną ekspertką w dziedzinie mikrobioty jelitowej i jej wpływu na zdrowie człowieka, zwłaszcza w kontekście osi mózgowo-jelitowej oraz zdrowia psychicznego. Jest prodziekanem Wydziału Nauk o Zdrowiu na Pomorskim Uniwersytecie Medycznym w Szczecinie oraz kierownikiem Zakładu Badań Biochemicznych. Jej interdyscyplinarne badania łączą mikrobiologię, biochemię oraz psychiatrię, co pozwala na kompleksowe podejście do zrozumienia roli mikrobioty w zaburzeniach zdrowotnych.

Czytaj więcej

Dr n. biol. Joanna Śliwa-Dominiak

Kierownik Laboratorium Kontroli Jakości w Centrum Badawczo-Rozwojowym SANPROBI

Dr Joanna Śliwa-Dominiak jest doświadczoną mikrobiolog, absolwentką Uniwersytetu Szczecińskiego, gdzie uzyskała stopień doktora nauk biologicznych. Jej prace badawcze koncentrują się na analizie szczepów bakterii probiotycznych oraz metodach ich identyfikacji i oceny skuteczności działania.

Czytaj więcej

Dr n. biol. Anna Wierzbicka-Woś

Kierownik Laboratorium Badawczo-Rozwojowego i Naukowego w Centrum Badawczo-Rozwojowym SANPROBI

Dr Anna Wierzbicka-Woś jest ekspertką z zakresu biotechnologii i metagenomiki, specjalizującą się w analizie mikrobiomów oraz mikroorganizmów, z wykorzystaniem innowacyjnych metod biologii molekularnej. Ukończyła studia doktoranckie na Uniwersytecie Szczecińskim i uzyskała stopień doktora nauk biologicznych.

Czytaj więcej

Dr n. med. i n. o zdr. Daniel Styburski

Pracownik Laboratorium Spektrometrii Mas w Centrum Badawczo-Rozwojowym SANPROBI

Dr Daniel Styburski jest specjalistą w dziedzinie spektrometrii mas oraz chromatografii cieczowej, z wieloletnim doświadczeniem w analizie metabolitów i profilowaniu metabolomicznym. Ukończył studia doktoranckie na Pomorskim Uniwersytecie Medycznym, gdzie zdobył rozległą wiedzę w zakresie identyfikacji metabolitów oraz badania ich roli w funkcjonowaniu mikroorganizmów.

Czytaj więcej

Dr n. med. Katarzyna Sielatycka

Samodzielny Specjalista ds. Cytometrii Przepływowej w Centrum Badawczo-Rozwojowym oraz Laboratorium Kontroli Jakości SANPROBI

Dr Katarzyna Sielatycka jest specjalistką w dziedzinie cytometrii przepływowej oraz biologii komórek macierzystych, z bogatym doświadczeniem zdobytym zarówno w Polsce, jak i za granicą. Kończyła studia doktoranckie z zakresu nauk medycznych, a swoje umiejętności badawcze rozwijała m.in. podczas 1,5-rocznego stażu naukowego w Instytucie Komórek Macierzystych na Uniwersytecie w Louisville (Kentucky, USA).

Czytaj więcej

Mgr Martyna Radaczyńska

Pracownik Laboratorium Kontroli Jakości oraz Laboratorium Mikrobiologii

Mgr Martyna Radaczyńska to doświadczona mikrobiolog, absolwentka Uniwersytetu Szczecińskiego, gdzie specjalizowała się w analizach mikrobiologicznych. Jej praca laboratoryjna koncentruje się na weryfikacji i walidacji metod mikrobiologicznych, kluczowych dla zapewnienia jakości badań związanych z monitorowaniem stabilności i skuteczności produktów probiotycznych.

Czytaj więcej

Mgr Alicja Zenka

Pracownik Laboratorium Kontroli Jakości oraz Laboratorium Mikrobiologii

Mgr Alicja Zenka jest absolwentką Biotechnologii Medycznej na Pomorskim Uniwersytecie Medycznym, gdzie zdobyła doświadczenie w analizach mikrobiologicznych. Specjalizuje się w badaniach nad mikroorganizmami probiotycznymi, z naciskiem na ich właściwości terapeutyczne oraz wpływ na zdrowie człowieka.

Czytaj więcej

Dr n. biol. Alicja Trzeciak-Ryczek

Pracownik Laboratorium Badawczo-Rozwojowego oraz pracownik Laboratorium Biologii Molekularnej

Dr Alicja Trzeciak-Ryczek jest specjalistą z zakresu biologii molekularnej. Ukończyła studia doktoranckie na Uniwersytecie Szczecińskim, gdzie za swoje osiągnięcia otrzymała Nagrodę Ministra za wybitne osiągnięcia dla doktorantów. W swojej pracy naukowej zajmowała się badaniem ekspresji genów z wykorzystaniem qPCR, fenotypowaniem komórek oraz oceną procesu apoptozy komórek z wykorzystaniem cytometrii przepływowej.

Czytaj więcej

Dr hab. n. med. Mariusz Kaczmarczyk

Kierownik Działu Analiz Bioinformatycznych i Statystycznych

Dr hab. Mariusz Kaczmarczyk ukończył z wyróżnieniem wydział lekarski Pomorskiej Akademii Medycznej w Szczecinie (aktualnie Pomorski Uniwersytet Medyczny w Szczecinie). Jest również absolwentem Politechniki Szczecińskiej (obecnie Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny) i posiada tytuł inżyniera w zakresie informatyki. W początkach swojej działalności naukowej koncentrował się na zagadnieniach biologii molekularnej i genomiki. Aktualnie jego zainteresowania skupiają się w obszarze metagenomiki ludzkiego mikrobiomu jelitowego.

Czytaj więcej

Dr n. med. Konrad Podsiadło

Pracownik Działu Analiz Bioinformatycznych i Statystycznych

Dr n. med. Konrad Podsiadło jest specjalistą w Dziale Analiz Bioinformatycznych i Statystycznych. Jest absolwentem Biotechnologii Medycznej na Pomorskim Uniwersytecie Medycznym w Szczecinie, gdzie zdobył wiedzę i umiejętności niezbędne do pracy w dziedzinie biostatystyki i bioinformatyki.

Czytaj więcej

Dr n. biol. Danuta Cembrowska-Lech

Pracownik Działu Analiz Bioinformatycznych i Statystycznych

Dr Danuta Cembrowska-Lech jest biologiem molekularnym i bioinformatykiem, specjalizującym się w analizie mikroorganizmów i mikrobiomów z wykorzystaniem zaawansowanych metod biologii obliczeniowej.

Czytaj więcej

wysokospecjalistyczna

Oferta

Analiza molekularna mikrobiomów ludzkich i środowiskowych

Metoda w oparciu o sekwencjonowanie nowej generacji (NGS). Etapy analizy:

izolacja materiału genetycznego z badanej populacji mikroorganizmów (etap opcjonalny);
konstrukcja biblioteki do sekwencjonowania NGS w oparciu o metodę amplifikacji wybranego fragmentu DNA lub metodę shotgun DNA;
sekwencjonowanie NGS w systemie Illumina;
analiza bioinformatyczna podstawowa lub rozszerzona, w zakresie analizy taksonomicznej i funkcjonalnej sekwencji, testowania hipotez statystycznych, data mining (metod eksploracyjnych podstawowych i wielowymiarowych, technik uczenia maszynowego);
analiza genomu mikroorganizmów prokariotycznych – od izolacji DNA i sekwencjonowania do analizy i opisu.

Cytometria przepływowa - precyzja w zliczaniu drobnoustrojów

Nowoczesny cytometr przepływowy CytoFLEX LX (Beckman Coulter) posiadający 6 laserów i 21 kanałów fluorescencyjnych.

Usługi badań zewnętrznych obejmują takie testy, jak:

ilościowa ocena bakterii w teście żywotności przeprowadzona zgodnie z normą ISO 19344, niezależnie od matrycy;
ilościowa ocena bakterii w teście oceniającym aktywność metaboliczną przeprowadzona zgodnie z normą ISO 19344, niezależnie od matrycy;
na życzenie wykorzystujemy metodę cytometryczną w badaniach stabilności produktów.

Ponadto:

ilościowa ocena mikropęcherzyków;
test ilościowego oznaczania białek - Cytometric bead array (CBA);
test proliferacji;
test apoptozy;
ocena cyklu komórkowego;
ilościowa ocena określonych fenotypów ludzkich i zwierzęcych komórek izolowanych z różnych materiałów (m.in. krwi obwodowej, krwi pępowinowej, szpiku kostnego).

Możliwość modyfikacji oznaczeń po konsultacji.

Cytometr przepływowy CytoFLEX LX (Beckman Coulter)

Wykorzystywany do ilościowej oceny bakterii, komórek ludzkich, komórek zwierzęcych oraz mikrocząsteczek. Dzięki wbudowanej pompie perystaltycznej wynik generowany jest jako ilość komórek na określoną objętość próbki.

Izolacja komórek o określonym fenotypie

Sorter komórkowy BD FACS Melody umożliwia wyizolowanie komórek o określonym fenotypie sortując w tym samym czasie 4 różne populacje komórkowe.

BD FACS Melody posiada:
4 lasery (czerwony 640 nm, niebieski 488 nm i fioletowy 405 nm)
9 parametów fluorescencji i 2 parametry rozproszenia (FSC i SSC).

BD FACS Melody ma standardową dyszę 100 μm.

Kontrola temperatury próbki umożliwia operatorowi ustawienie temperatury próbki na 4°C, 20°C, 37°C lub 42°C.

Instrument jest wyposażony w opcję lodówki/grzałki, która zapewnia chłodzenie lub ogrzewanie probówek zbierających, płytek wielodołkowych lub szkiełek.

Sorter komórkowy BD FACS Melody

Pozwala sortować wysokiej jakości określone populacje komórkowe, bez wpływu na ich żywotność. Dzięki temu mogą być one użyte do hodowli komórkowych, badań cytometrycznych i różnego typu analiz.

Badania spektrometryczne

Wykonywane są na jednym z najbardziej zaawansowanych na rynku urządzeń, jakim jest spektrometr mas z kwadrupolem i analizatorem czasu przelotu (Q-ToF-MS) – AB Sciex TripleTof® 6600+, sprzężonym z wysokosprawnym chromatografem cieczowym – AB Sciex Exion LC AD. Usługa obejmuje takie testy, jak:

niecelowana metabolomika prób pochodzenia biologicznego (analiza jakościowa),
oznaczanie krótkołańcuchowych kwasów tłuszczowych (SCFA) w materiale biologicznym (analiza ilościowa),
jakościowa analiza metabolitów zawartych w medium komórkowym wraz z ilościowym pomiarem wybranych metabolitów.

nowoczesne

Wyposażenie laboratorium

Szczegółowy opis sprzętu CBR znajdziesz: TUTAJ

System real-time PCR

Zaprogramowany do różnicowania poszczególnych rodzajów, gatunków i szczepów bakteryjnych przy zastosowaniu szeregu barwników fluorescencyjnych: FAM™/SYBR™Green, VIC™/JOE™/HEX™/TET™, ABY™/NED™/TAMRA™/Cy™3, JUN™, ROX™/TexasRed™, Mustang Purple™, Cy5™/LIZ™, CY™5.5.; umożliwia także określenie liczby bakterii. Dodatkowo istnieje możliwość badania ekspresji microRNA w pojedynczych próbkach.

Western blot

Urządzenie do badania ekspresji genów na poziomie białka. Posiada zestaw do elektroforezy i transferu oraz system wizualizacji.

Sekwenator kapilarny

Kompleksowe urządzenie umożliwiające sekwencjonowanie i analizę długości fragmentów DNA metodą kapilarną. Dokładność odczytu przy sekwencjonowaniu aparatem w laboratorium Sanprobi jest nie mniejsza niż 98% a dokładność odczytu przy analizie fragmentów nie mniejsza niż 99,9%. Aparat ma możliwość porównań sekwencji DNA do sekwencji wzorcowej, analizy polimorfizmów pojedynczych nukleotydów, wykrywania mutacji, oznaczania heterozygotyczności, wyszukiwania określonej sekwencji – na potrzeby badań, zwłaszcza klinicznych, i przy archiwizacji wyników.

Czytnik ELISA

Uniwersalny spektrofotometryczny czytnik, za pomocą którego – przy wykorzystaniu zestawów immunoenzymatycznych – będą mogły być oznaczane stężenia białek ważnych z punktu widzenia sprawności działania bariery jelitowej. Czytnik ten umożliwia również pomiar stężeń kwasów nukleinowych (DNA i RNA).

Homogenizator kulowy

Urządzenie niezbędne przy izolacji materiału genetycznego z komórek bakterii.

Mikroskop świetlny

Urządzenie niezbędne do oceny morfologii komórek bakterii.

Komora klimatyczna

Urządzenie służące do badań stabilności produktu.

Zamrażarka nieskotemperaturowa

W zamrażarce przechowuje się materiał biologiczny, aby nie stracił swoich właściwości.

Cytometr przepływowy

Urządzenie służące do oceny właściwości cytochemicznych i cytogennych komórek, do określania immunofenotypu, potencjału proliferacyjnego i apoptotycznego.

Sorter komórkowy

Działanie sortera komórkowego jest oparte na pomiarze fluorescencji, co pozwala izolować komórki zawieszone w płynie. Daje to możliwość separacji komórek w oparciu o kilkanaście ich cech jednocześnie. Umożliwia wykrywanie, charakterystykę oraz ustalenie liczby mikroorganizmów oraz komórek somatycznych łącznie z ich separacją. Urządzenia tego rodzaju pozwalają zbierać populacje o czystości powyżej 98% i żywotności powyżej 95%. Sorter komórkowy rozszerza możliwości działania cytometru przepływowego.

Sekwenatory nowej generacji

Sekwenatory wyprodukowane przez firmę Illumina, modele MiSeq oraz iSeq100. Aparaty do sekwencjonowania nowej generacji (NGS) wielu sekwencji jednocześnie. Umożliwiają odczytywanie sekwencji wielu różnych fragmentów DNA jednocześnie, dzięki czemu możliwe jest poznawanie metagenomów badanych prób.

Dział Badawczo-Rozwojowy SANPROBI dysponuje laboratorium o najnowocześniejszym wyposażeniu, które umożliwia zaawansowane badania nad mikroorganizmami i ich wpływem na organizm człowieka.

jeszcze więcej o nas

Sprawdź również