Izolacja materiału genetycznego jest przeprowadzana w zależności od rodzaju próby i przygotowania materiału. Stosowane zestawy odczynników są dobierane do specyfiki materiału, a cała procedura jest przeprowadzona na zoptymalizowanych protokołach. Do izolacji wykorzystywane są metody manualne (Qiagen, ZymoResearch) oraz zautomatyzowane (AutoPure Mini z odczynnikami A&A Biotechnology) bazujące na homogenizacji z wykorzystaniem kulek ceramicznych. 


Materiał genetyczny po izolacji jest sprawdzany pod kątem ilościowym i jakościowym z wykorzystaniem metod fluorymetrycznej oraz spektrofotometrycznej.