ASV charakteryzują się większą rozdzielczością niż tradycyjne operacyjne jednostki taksonomiczne (OTU, ang. operational taxonomic units), co umożliwia dokładniejszą charakterystykę różnorodności mikrobiologicznej oraz profili taksonomicznych w analizowanych próbkach.. Dzięki zastosowaniu procedury usuwania amplikonów nieswoistych (niebakteryjnych, off-target amplification) oraz użyciu sekwencji typu forward na etapie odszumiania  sekwencji (ang. denoising) pozwala na poprawę dokładności analiz bioróżnorodności oraz taksonomicznych.